Arrow CSV 读取器在同一文件上返回多个 null 值
来源:stackoverflow
时间:2024-02-19 09:36:23 491浏览 收藏
在IT行业这个发展更新速度很快的行业,只有不停止的学习,才不会被行业所淘汰。如果你是Golang学习者,那么本文《Arrow CSV 读取器在同一文件上返回多个 null 值》就很适合你!本篇内容主要包括##content_title##,希望对大家的知识积累有所帮助,助力实战开发!
我正在尝试使用多个 goroutine 读取同一个文件,其中每个 goroutine 都分配了一个字节来开始读取,并分配了一些行来读取 linelimit
。
通过将 csv.chunksize
选项设置为 chunksize
变量,当文件适合内存时,我成功地做到了这一点。但是,当文件大于内存时,我需要减少 csv.chunksize
选项。我正在尝试这样的事情
package main import ( "io" "log" "os" "sync" "github.com/apache/arrow/go/v11/arrow" "github.com/apache/arrow/go/v11/arrow/csv" ) // A reader to read lines from the file starting from the byteOffset. The number // of lines is specified by linesLimit. func produce( id int, ch chan<- arrow.Record, byteOffset int64, linesLimit int64, filename string, wg *sync.WaitGroup, ) { defer wg.Done() fd, _ := os.Open(filename) fd.Seek(byteOffset, io.SeekStart) var remainder int64 = linesLimit % 10 limit := linesLimit - remainder chunkSize := limit / 10 reader := csv.NewInferringReader(fd, csv.WithChunk(int(chunkSize)), csv.WithNullReader(true, ""), csv.WithComma(','), csv.WithHeader(true), csv.WithColumnTypes(map[string]arrow.DataType{ "Start_Time": arrow.FixedWidthTypes.Timestamp_ns, "End_Time": arrow.FixedWidthTypes.Timestamp_ns, "Weather_Timestamp": arrow.FixedWidthTypes.Timestamp_ns, })) reader.Retain() defer reader.Release() var count int64 for reader.Next() { rec := reader.Record() rec.Retain() // released at the other end of the channel ch <- rec count += rec.NumRows() if count == limit { if remainder != 0 { flush(id, ch, fd, remainder) } break } else if count > limit { log.Panicf("Reader %d read more than it should, expected=%d, read=%d", id, linesLimit, count) } } if reader.Err() != nil { log.Panicf("error: %s in line %d,%d", reader.Err().Error(), count, id) } } func flush(id int, ch chan<- arrow.Record, fd *os.File, limit int64, ) { reader := csv.NewInferringReader(fd, csv.WithChunk(int(limit)), csv.WithNullReader(true, ""), csv.WithComma(','), csv.WithHeader(false), ) reader.Retain() defer reader.Release() record := reader.Record() record.Retain() // nil pointer dereference error here ch <- record }
我尝试了之前代码的多个版本,包括:
- 复制文件描述符
- 复制文件描述符的偏移量,打开同一个文件 并寻求这种抵消。
- 在调用
flush
或关闭第一个fd
之前关闭第一个读取器。
无论我如何更改代码,错误似乎都是相同的。请注意,对 flush
的阅读器的任何调用都会引发错误。包括reader.next
和reader.err()
。
我使用 csv 阅读器是否错误?这是重复使用同一文件的问题吗?
编辑:我不知道这是否有帮助,但是在没有任何 seek
的 flush
中打开一个新的 fd 可以避免该错误(不知何故,任何 seek
都会导致出现原始错误)。但是,如果没有 seek
,代码就不正确(即删除 seek
会导致任何 goroutine 根本无法读取文件的一部分)。
正确答案
主要问题是,csv阅读器在下面使用了bufio.reader
,其默认缓冲区大小为4096。这意味着reader.next()
将读取比需要更多的字节,并缓存额外的字节。如果在 reader.next()
之后直接从文件中读取,将会错过缓存的字节。
下面的演示展示了这种行为:
package main import ( "bytes" "fmt" "io" "os" "github.com/apache/arrow/go/v11/arrow" "github.com/apache/arrow/go/v11/arrow/csv" ) func main() { // Create a two-column csv file with this content (the second column has 1024 bytes): // 0,000000.... // 1,111111.... // 2,222222.... // 3,333333.... temp := createTempFile() schema := arrow.NewSchema( []arrow.Field{ {Name: "i64", Type: arrow.PrimitiveTypes.Int64}, {Name: "str", Type: arrow.BinaryTypes.String}, }, nil, ) r := csv.NewReader( temp, schema, csv.WithComma(','), csv.WithChunk(3), ) defer r.Release() r.Next() // To check what's left after the first chunk is read. // If the reader stop at the end of the chunk, the content left will be: // 3,333333.... // But in fact, the content left is: // 33333333333 buf, err := io.ReadAll(temp) if err != nil { panic(err) } fmt.Printf("%s\n", buf) } func createTempFile() *os.File { temp, err := os.CreateTemp("", "test*.csv") if err != nil { panic(err) } for i := 0; i < 4; i++ { fmt.Fprintf(temp, "%d,", i) if _, err := temp.Write(bytes.Repeat([]byte{byte('0' + i)}, 1024)); err != nil { panic(err) } if _, err := temp.Write([]byte("\n")); err != nil { panic(err) } } if _, err := temp.Seek(0, io.SeekStart); err != nil { panic(err) } return temp }
第二个读取器的目的似乎是防止它读取另一个 csv 数据块。如果您提前知道下一个 csv 数据块的偏移量,则可以将文件包装在 io.sectionreader
中,使其仅读取当前的 csv 数据块。当前的问题没有提供有关这部分的足够信息,也许我们应该将其留给另一个问题。
注释:
fd, _ := os.open(filename)
: 永远不要忽略错误。至少记录它们。fd
大多数时候表示文件描述符。不要将其用于*os.file
类型的变量,尤其是当*os.file
有一个方法fd
时。
终于介绍完啦!小伙伴们,这篇关于《Arrow CSV 读取器在同一文件上返回多个 null 值》的介绍应该让你收获多多了吧!欢迎大家收藏或分享给更多需要学习的朋友吧~golang学习网公众号也会发布Golang相关知识,快来关注吧!
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